Tätigkeit als Wissenschaftler:

Michael Rot ist Herausgeber und Editionsleiter der Verlagsgruppe Hermann (Strauss Edition Wien / Edition Meisterwerke).
- In der Strauss Edition Wien ist er Herausgeber der Neuen Johann Strauss Gesamtausgabe, die von der Neuausgabe zahlreicher ausgewählter Werke aller Mitglieder der Strauss – Dynastie und anderer Komponisten der Wiener Tanzmusik begleitet wird.
Mit dem RotVerzeichnis (RV) hat er erstmalig ein System zur vollständigen Katalogisierung aller Werke von Johann Strauss Sohn erstellt.

In der Edition Meisterwerke hat Michael Rot bisher folgende kritische Neuausgaben vorgelegt:
- Bizets „Carmen“ – erstmals in sieben Fassungen und Rekosntruktion der Urfassung
- Puccinis „Tosca“ – Erstpublikation von Puccinis autographer Urfassung
- Mussorgskijs „Boris Godunov“- erstmals in sieben Fassungen
- Tschaikowskijs „Pique Dame“ – erstmals in vier Fassungen
- Offenbachs „La grande Duchesse de Gérlostein“
- die Symphonien von P. I. Tschaikowskij
In Vorbereitung für 2010: Kritische Neuausgabe nach dem Autograph von Verdis Falstaff.
In Vorbereitung für 2011: Gesamtausgabe aller Liszt Lieder in allen Fassungen und Sprachen gemeinsam mit der neu erscheinenden CD-Gesamtaufnahme.
Weiters in Vorbereitung ist eine neue Bruckner Edition.