Michael Rot ist seit 1976 Lehrer an der Universität für Musik und Darstellende Kunst (damals noch Hochschule für Musik).

Er unterrichtet am Institut für Gesang und Musiktheater, wo er seit 1980 eine Klasse für Musikalische Interpretation der Oper leitet.

Im Wintersemester 2009/10 übernahm Michael Rot die musikalische Leitung einer Klasse für Musikdramatische Darstellung.